Point d'entrée sur Flores des touristes et voyageurs arrivant de Bali, le village initial de pêcheurs bajo (comme son nom l'indique) s'est profondément transformé. Il reste une destination d'esprit routard et facile à vivre, même si elle sonne de plus en plus artificielle.
Les liaisons aériennes nombreuses sont en cohérence avec le développement touristique: liaisons directes avec Denpassar (Bali), Makassar (Sulawesi), Kupang (Timor), mais aussi Bajawa, Ende et Maumere.
Labuanbajo n'est souvent qu'une étape pour partir en mini-croisière dans l'archipel de Komodo ou pour traverser Flores vers l'est. Une alternative moins utilisée pour visiter Komodo est de partir de Sape accessible par la route depuis l'aéroport de Bima.
Des hôtels fort luxueux se sont installés au nord et au sud de la ville.